O número de atos terroristas no Japão nunca foi tão baixo, graças aos esforços de um sindicato chamado Direct Attack (DA). A organização cria meninas órfãs como assassinas para cometer assassinatos no âmbito do programa "Lycoris". Takina Inoue é uma Lycoris excepcional com um forte senso de propósito e uma propensão à perfeição. Infelizmente, uma situação com reféns testa sua paciência, e o ato de insubordinação resultante leva à sua transferência para fora da promotoria. Não entusiasmada por perder o único lugar ao qual pertencia, ela relutantemente chega à sua nova base de operações – LycoReco, um café disfarçado. O novo parceiro de Takina, porém, acaba sendo bem diferente do que ela imaginava. Apesar de ser o famoso prodígio Lycoris, Chisato Nishikigi parece quase despreocupada com seus deveres. Ela arrasta Takina em todos os tipos de biscates sob a simples explicação de ajudar as pessoas necessitadas. Takina fica ainda mais intrigado quando Chisato derruba um grupo de agressores armados sem matar nenhum deles. Sentindo-se como um peixe fora d’água, Takina anseia por ser reintegrada na AD – mas Chisato está determinada a provar a ela que há mais na vida do que apenas tirá-los.
