Depois que uma guerra horrível causou estragos na população em geral, os governos do mundo recorreram a uma tática mais evasiva para promover suas agendas - uma guerra travada nas sombras. Lily, uma linda garota de cabelos brancos, é aluna de uma das muitas instituições que treinam jovens para se tornarem espiões competentes. Infelizmente, apesar de pontuar bem nos exames escritos, ela mal consegue passar nas práticas. Sem habilidades do mundo real para falar, suas esperanças de se formar são sombrias - até que ela recebe uma oportunidade de se juntar à misteriosa equipe "Tomoshibi" e participar de uma missão intransponível. Animada com a perspectiva de trabalhar com a elite, Lily aceita com entusiasmo. No entanto, ela fica muda quando chega ao Palácio Kagerou e o verdadeiro propósito de Tomoshibi e sua situação desesperadora vem à tona. Juntamente com outras espiãs problemáticas, juntamente com um jovem misterioso liderando a operação, Lily percebe que esta não é a escapada ideal que ela imaginou.
